Carlo Becerra

Biólogo Molecular con sólida formación en investigación y docencia, con experiencia en microbiología vegetal y bioinformática. He desarrollado habilidades sólidas en diseño experimental, análisis de datos NGS, y cultivo de microorganismos. Mi experiencia en la identificación y caracterización de microorganismos asociados a plantas, así como en el análisis de genomas virales, me permite aportar conocimientos valiosos en investigación vegetal. Actualmente curso una Maestría en Ciencias-Biología, lo que me brinda una base sólida en teoría y me mantiene actualizado en las últimas tendencias de la investigación en biología molecular. Mis logros incluyen la identificación de virus y plásmidos en endófitos de mangle, así como la creación y mantenimiento de un cepario de microbioma central de plantas modelo. Busco aplicar mis conocimientos y habilidades en un entorno dinámico como la investigación, contribuyendo al desarrollo de nuevas variedades, la mejora de la calidad de los cultivos y la resolución de problemas fitosanitarios.

Universidad del Valle / Asistente de docencia e investigación / Agosto 2023 – Diciembre 2024

Responsabilidades claves:

Docencia:

Preparación de materiales para las sesiones de laboratorio: Esto incluye la preparación de soluciones, reactivos, medios de cultivo y cualquier otro material necesario para las prácticas.

Acompañamiento a estudiantes durante las prácticas: Brindar apoyo técnico a los estudiantes durante las sesiones de laboratorio, respondiendo preguntas, supervisando el uso adecuado de los equipos y asegurando el cumplimiento de las normas de seguridad.

Manejo de equipos e instrumentos de laboratorio: Operación de equipos comunes en un laboratorio de bioquímica, como espectrofotómetros, microscopios, balanzas, etc. 

Análisis de datos con softwares y plataformas especializadas: Utilización de software como R, BLAST, EMBOSS, MEGA, Galaxy, NCBI, entre otras, empleadas para el análisis de datos generados en las prácticas de laboratorio (análisis de secuencias de ADN, ARN y análisis estadístico de datos experimentales).

Asesoría a estudiantes: Brindar apoyo a los estudiantes en la comprensión de los conceptos teóricos y en la resolución de problemas relacionados con las prácticas de laboratorio.

Cumplimiento de normas de bioseguridad: Aplicar y promover las normas de bioseguridad en el laboratorio, asegurando un entorno de trabajo seguro para los estudiantes y el personal.

Investigación:

Extracción y purificación de ácidos nucleicos: Aislamiento de ADN y ARN de alta calidad a partir de muestras de tejido vegetal y microorganismos asociados.

Amplificación de genes de interés: Diseño y realización de PCRs para amplificar genes marcadores.

Preprocesamiento de librerías metagenómicas y metatranscriptómicas: Limpieza y filtrado de datos de secuenciación (NGS) para eliminar lecturas de baja calidad y adaptadores.

Ensamblaje de genomas virales: Construcción de ensamblados de genomas de alta calidad a partir de datos de secuenciación de novo.

Anotación taxonómica y funcional: Identificación taxonómica viral y anotación de genes, elementos repetitivos (transposones, retrotransposones), y otros elementos genómicos.

Logros destacables: 

Renovación de mi vinculación como asistente de docencia por tres semestres consecutivos gracias a mi alto desempeño en las evaluaciones.

Identificación taxonómica y funcional de virus y plásmidos asociados a endófitos de dos plantas de mangle.
 

Universidad del Valle / Asistente de investigación / Septiembre 2022 -Diciembre 2022

Responsabilidades claves:

Preparación de medios de cultivo y soluciones: Esto incluye la preparación de diferentes tipos de medios de cultivo para bacterias y hongos, así como la preparación de soluciones con diferentes concentraciones y pH para su uso en experimentos con plantas.

Esterilización de material vegetal y de laboratorio: Implica la aplicación de diferentes métodos de esterilización para asegurar la ausencia de contaminantes en los experimentos con plantas.

Análisis de datos de secuenciación de ADN: Esto comprende el análisis bioinformático de secuencias de ADN para la identificación de microorganismos y el estudio de la diversidad microbiana.

Elaboración de protocolos y documentación de experimentos: Implica la elaboración de protocolos detallados para los experimentos, así como el registro preciso de los resultados y observaciones. 

Logros destacables:

Creación y mantenimiento de un cepario de microbioma central de cuatro especies de plantas modelo (Arabidopsis thaliana, Brachypodium distachyon, maíz y tomate), que sirvió como recurso para estudios de interacción planta-microbioma. Identificación de bacterias asociadas mediante análisis de secuencia de ADN por código de barras, permitiendo caracterizar la diversidad microbiana.

Educación formal y complementaria

   • Máster en Ciencias-Biología / Universidad del Valle / Febrero 2023 - Actualidad
Promedio acumulado: 4.48

   • Biólogo / Universidad del Valle  /Marzo 2016 - Junio 2022
Promedio acumulado: 4.32

   • Programa de Cualificación docente: Gamificación y Herramientas Digitales / Universidad del Valle / Octubre 2024

   • Programa de Cualificación docente: Programa investigadores noveles: 5 trucos para poder publicar / Universidad del Valle / Octubre 2024

   • Chinese for Beginners / Peking University- Coursera / Septiembre 2020
Nivel: Básico

   • The Data Scientist’s Toolbox / Johns Hopkins University- Coursera / Julio 2020
Calificación: Aprobado